Выявление условно-патогенных микроорганизмов методом ПЦР в режиме реального времени, тест-система БакСкринУПМ (BakSkrin. Detection of conditionally pathogenic microorganisms by PCR in real time)
Описание обследования
Метод определенияПЦР с детекцией в режиме реального времени.
Исследуемый материал
Смотрите в описании
Синонимы: Выявление условно-патогенных микроорганизмов методом ПЦР.
BakSkrin, PCR.
Краткое описание исследования «Выявление условно-патогенных микроорганизмов методом ПЦР»
Инфекционные болезни и в современном мире остаются одной из ведущих проблем медицины, в значительной степени определяя и здоровье людей, и продолжительность жизни.
Патогенность возбудителей инфекционных болезней – отличительный признак, позволяющий подразделять микроорганизмы на группы. К условно-патогенным микроорганизмам (УПМ) относятся возбудители, вызывающие развитие инфекционного процесса только при определенных условиях, например, при снижении иммунитета.
Часть этих бактерий представлена свободноживущими микроорганизмами (Pseudomonas spp., Acinetobacter spp.). Иногда они попадают на эпителиальные поверхности или во внутреннюю среду организма человека и могут вызывать инфекционные заболевания.
Другая группа адаптирована к существованию в нестерильных частях организма человека, связанных с окружающей средой. Это кожный покров, желудочно-кишечный тракт, верхние отделы дыхательных путей. Ее представители составляют нормальную (эндогенную) микрофлору человека, но различаются по вирулентности. Одни из них практически никогда не вызывают заболеваний человека, другие – часто, например, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Haemophilus influenzae.
Различные виды бактерий проявляют тропность к определенным анатомическим нишам. В связи с этим каждому биотопу организма свойственна своя относительно постоянная флора. Являясь одним из защитных механизмов организма, она также может быть и резервуаром возбудителей экзо- и эндогенных инфекций. В каждом биоценозе регистрируются как резидентные, так и транзиторные микроорганизмы, среди которых немаловажное значение имеют условно-патогенные представители. Отдельные виды УПМ участвуют в формировании нормальной микрофлоры макроорганизма и в патогенезе ряда заболеваний.
Представители УПМ могут вызывать инфекционные процессы при самых разнообразных внешних и внутренних изменениях и условиях, таких как:
прием различных медикаментов (иммунодепрессантов, гормонов, антибактериальных препаратов и т. д.);
воздействие неблагоприятных факторов окружающей среды;
снижение иммунитета;
стационарное лечение;
беременность и роды;
преклонный и детский возраст;
травматические состояния (механические повреждения целостности кожи, ожоги и др.);
хронические заболевания (диабет, онкологические болезни и т. д.).
Особый интерес представляют заболевания, которые вызываются условно-патогенными микроорганизмами в стационарах, – нозокомиальные (госпитальные) инфекции.
Исследование позволяет выявить ДНК микроорганизма-возбудителя инфекционного заболевания методом ПЦР
Achromobacter ruhlandii
Achromobacter xylosoxidans
Acinetobacter spp.
Burkholderia spp.
Enterobacteriales
Citrobacter freundii
Citrobacter koseri
Enterobacter cloacae
Escherichia coli
Klebsiella pneumoniae + Klebsiella oxytoca
Klebsiella pneumoniae
Morganella morganii
Proteus spp.
Serratia marcescens
Enterococcus spp.
Haemophilus spp.
Haemophilus infl uenzae
Pseudomonas aeruginosa
Staphylococcus spp.
Staphylococcus aureus
Stenotrophomonas maltophilia
Streptococcus spp.
Streptococcus agalactiae
Streptococcus pneumoniae
Streptococcus pyogenes
Бланк с результатом содержит информацию о выявленной ДНК условно-патогенных микроорганизмов.
С какой целью выполняют исследование «Выявление условно-патогенных микроорганизмов методом ПЦР»
Предназначен для выявления ДНК условно-патогенных бактерий классов Bacilli, Betaproteobacteria и Gammaproteobacteria, вызывающих нозокомиальные и внебольничные инфекции, в препаратах ДНК, полученных из биологического материала человека и бактериальных культур из этого биоматериала (мокрота, моча, мазки/соскобы из дыхательных путей, желудочно-кишечного и урогенитального тракта, фекалии, аспираты, экссудаты) методом ПЦР в режиме реального времени.
Что может повлиять на результат исследования «Выявление условно-патогенных микроорганизмов методом ПЦР»
Несоблюдение правил подготовки к исследованию может повлиять на результат.
Литература
1. Бабяк А. С., Полина А. В. Резистентность микроорганизмов к противомикробным препаратам //Международный студенческий научный вестник. – 2017. – №. 6. – С. 11-11.
2. Белобородов Б. В. и др. Диагностика и антимикробная терапия инфекций, вызванных полирезистентными микроорганизмами //Вестник анестезиологии и реаниматологии. – 2020. – Т. 17. – №. 1. – С. 52.
3. Гончаров А. Е. и др. Молекулярно-эпидемиологический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи. Федеральные клинические рекомендации – М., 2014. – 45 с.
4. Клинические рекомендации. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. – 2018.
5. Первухин С. А. и др. Антибиотикорезистентность грамотрицательных возбудителей нозокомиальной пневмонии у пациентов отделения реанимации и интенсивной терапии //Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2019. – Т. 21. – №. 1. – С. 62-68.
6. Сухорукова М. В. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacterales в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН 2015-2016 //Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2019. – Т. 21. – №. 2. – С. 147-159.
7. Фармакология с рецептурой: учебник для медицинских и фармацевтических учреждений среднего профессионального образования / Под ред. В. М. Виноградова. — 6-е изд., испр. и доп. // – СПб.: СпецЛит. – 2018. – 647 с.
8. Яковлев С. В. и др. Стратегия и тактика рационального применения антимикробных средств в амбулаторной практике. Евразийские клинические рекомендации. 2016 год //Педиатрия. Приложение к журналу Consilium Medicum. – 2017. – №. 1. – С. 17-25.
9. Яковлев С. В., Суворова М. П., Быков А. О. Инфекции, вызванные карбапенеморезистентными энтеробактериями: эпидемиология, клиническое значение и возможности оптимизации антибактериальной терапии //Антибиотики и химиотерапия. – 2020. – Т. 65. – №. 5-6. – С. 41-69.
10. Якупова А. Ф. и др. Современные методы диагностики в бактериологической лаборатории //Научный Лидер. – 2022. – С. 25.
11. Alcock B. P. et al. CARD 2020: antibiotic resistome surveillance with the comprehensive antibiotic resistance database //Nucleic acids research. – 2020. – Т. 48. – №. D1. – С. D517-D525.
12. Gajic I. et al. Antimicrobial susceptibility testing: A comprehensive review of currently used methods //Antibiotics. – 2022. – Т. 11. – №. 4. – С. 427.
13. Kalland K. H., Kommedala Ø., Ulvestada E. 11 Molecular Microbial Diagnostics //Genomics and Clinical Diagnostics. – 2019. – С. 299.
14. Tsang K., Speicher D., McArthur A. Pathogen taxonomy updates at the comprehensive antibiotic resistance database: implications for molecular epidemiology. – 2019.